Zagadnienia Filozoficzne w Nauce to czasopismo wydawane pod auspicjami Centrum Kopernika Badań Interdyscyplinarnych i Ośrodka Badań Interdyscyplinarnych w Krakowie. Specyfika tego pisma, w porównaniu z innymi zajmującymi się podobną tematyką, polega na tropieniu i analizowaniu problemów filozoficznych uwikłanych w nauki przyrodnicze. Takie teorie naukowe, jak ogólna teoria względności, mechanika kwantowa, teoria ewolucji czy koncepcje powstałe na gruncie nauk kognitywnych prowadzą do pytań o wyraźnym wydźwięku filozoficznym.
Dla zrozumienia, czym jest nauka i skąd bierze się jej sukces, a także jakie są jej powiązania z filozofią, doniosłe znaczenie mają też publikowane na łamach Zagadnień prace z historii i metodologii nauk. Pismo, obok artykułów naukowych, zawiera też duży dział recenzji. W Zagadnieniach publikują nie tylko krakowscy uczeni, ale także autorzy z innych, również zagranicznych ośrodków naukowych.